Di Jepang tahun 1864, seorang wanita muda bernama Chizuru Yukimura sedang mencari ayahnya yang hilang, Koudou, seorang dokter yang pekerjaannya sering membawanya jauh dari rumah. Namun, tanpa kabar darinya selama berbulan-bulan, Chizuru menyamar sebagai seorang pria dan pergi ke Kyoto untuk mencarinya. Menarik perhatian para ronin, ia mencoba bersembunyi dan akhirnya menyaksikan pemandangan yang mengerikan: sang ronin dibunuh secara brutal oleh pria-pria berambut putih yang gila. Dalam rangkaian peristiwa yang mengejutkan, anggota Shinsengumi tiba untuk menghabisi makhluk-makhluk itu. Namun, keselamatan Chizuru tidak bertahan lama, karena sekelompok pria ini mengikatnya dan membawanya kembali ke markas mereka, tidak yakin apakah akan membiarkannya hidup atau membungkamnya selamanya.
Namun, begitu ia mengungkapkan nama ayahnya, Shinsengumi memutuskan untuk menjaganya tetap aman, karena mereka juga telah mencarinya. Namun, Koudou ternyata lebih terhubung dengan Shinsengumi daripada yang mereka akui, dan Chizuru pun segera terlibat dalam konflik antara Shinsengumi dan musuh-musuh mereka, serta ketegangan politik di Kyoto.
